Budou rozvinuté účinné optické metody citlivého sledování biomolekulárních interakcí v malých objemech vzorků bez nutnosti zavádění molekulárních značek do interakčního místa a budou aplikované při studiu těch interakcí nukleová kyselina – protein, kteréhrají významnou roli v regulaci genové exprese a v „antisense“ terapii. U vybraných štěpících a regulačních enzymů bude sledována tvorba, struktura a biochemická aktivita jejich komplexů s nukleovými kyselinami. Metodický vývoj bude zahrnovat (i) technické a matematické řešení přesných měření Ramanova rozptylu v nmol množstvích, (ii) konstrukci senzorového systému vysokého rozlišení s až osmi v reálném čase měřícími kanály, založeném na rezonanci povrchových plasmonů, (iii) vypracování komplexních interakčních modelů pro biomolekuly zahrnujících i vliv hydrodynamických podmínek, (iv) přípravu modifikovaných oligonukleotidů s různou strukturou cukr – fosfátové páteře.
