Projekt se zabývá vlastnostmi důležitých úseků nukleových kyselin (NA) z hlediska jejich strukturních fluktuací a kinetiky tvorby a zániku strukturních útvarů, případně jejich komplexů. Hlavní důraz bude kladen na použití široké škály pokročilých experimentálních technik včetně mikro-Ramanovy spektroskopie, senzorů na bázi rezonance povrchových plasmonů (SPR) a dynamických NMR měření na 13C-značených nukleotidech, doplněných molekulárně-dynamickými simulacemi. Výzkum bude zaměřen na několik skupin NA strukturních motivů významných pro přirozenou či uměle řízenou regulaci genové exprese. Kromě důkladného porozumění strukturním a dynamickým vlastnostem přirozených i chemicky modifikovaných NA strukturních motivů dojde i k rozvoji určitých experimentálních technik, konkrétně k vývoji směšovacího mikrofluidního systému pro mikro-Ramanova měření a k implementaci nové koncepce SPR snímání s polarizačním kontrastem pro vysoce paralelizovaná měření.